Jeolojik yapıya bağlı olarak sondaj delikleri temizlenmelidir. En yaygın delik temizleme yöntemi, yüksek basınçlı akış kompresörü ile delik temizlemedir.
Sondaj temizliği belirli yıllar aralarında yapılmalıdırlar aksi takdir sondaj kuyunuz kapanabilir ve kuyudan çıkacak olan suyun kirli bir şekilde çıkmasına yol açar.
